Лаборатория биоинформатики

Информация о лаборатории

Лаборатория биоинформатики была создана в 2013 г. Сотрудники нашей лаборатории - это команда высококвалифицированных молодых ученых-биоинформатиков, выпускников и студентов лучших вузов страны. Мы применяем свои навыки и знания в биоинформатическом и статистическом анализах, а также в биологической интерпретации полученных результатов. Участвуем в российских и международных конференциях, в международных научно-исследовательских проектах, а также проводим школы по биоинформатике. С 2010 года мы активно участвуем в проекте Русский Метагеном - metagenome.ru

Наши научные интересы

  • Анализ omics данных
    • Геномика (изучение эволюции прокариот, связь с изменением стиля жизни, патогенностью)
    • Транскриптомика (прокариот, эукариот, анализ альтернативного сплайсинга)
    • Метагеномика (в т.ч. вирусная метагеномика)
  • Исследование взаимодействия бактерий между собой и с организмом хозяина
  • Взаимодействие бактериофагов с бактерией-хозяином
  • Изучение механизмов горизонтального переноса генов
  • Гетерогенность бактериальных популяций
  • Изучение координации процессов, происходящих в живых клетках

Наши навыки

  • Разработка биоинформатических пайплайнов обработки данных секвенирования.
  • Анализ данных на R и Python (биологическая статистика, машинное обучение и др).
  • Проведение ресурсоемких вычислений на вычислительном кластере нашего центра.
  • Программирование на Python, Perl, R, Java, Bash, C/C++, Go, Javascript, C#, Scala

Увлечения

Биология, программирование и участие в различных хакатонах, походы, путешествия, артхаус, философия, видеоигры, киноклуб, фантастическая литература.